Des analyses AFLP (polymorphisme de longueur des fragments amplifiés) ont été réalisées afin d'évaluer la biodiversité chez l'un des plus importants diptères ravageurs des céréales, la cécidomyie asiatique du riz (Orseolia oryzae Wood Mason). Des larves et des pupes ont été collectées sur 15 sites situés dans cinq pays asiatiques et préservées dans de l'alcool à 95 % en vue de l'entreposage, de l'expédition et de l'extraction d'ADN à l'aide de bromure de cétyltriméthylammonium (CTAB). Bien que seulement ~1 µg ait été extrait des pupes ou larves individuelles, l'emploi de plusieurs amorces AFLP en diverses combinaisons a fait que cette quantité d'ADN s'est avérée suffisante pour obtenir plusieurs empreintes génétiques pour chaque individu. Les empreintes étaient suffisamment reproductibles, surtout lors de l'amplification sélective, pour permettre de caractériser la diversité génétique parmi des populations de champ. L'extraction d'ADN à partir d'un groupe de 20 insectes a permis de produire des empreintes AFLP chez lesquelles la capacité de détecter des variations entre individus a été échangée contre la possibilité de déceler des différences entre populations. Pour chaque site de collecte, l'ADN provenant d'un groupe d'insectes a été amplifié avec trois paires d'amorces. Au total, 261 bandes AFLP distinctes ont été identifiées parmi les 45 empreintes produites. Une analyse de groupement selon l'association moyenne (UPGMA) a permis de séparer les populations en deux groupes distincts. Le groupe I incluait deux populations provenant de la province de Guangdong dans le sud de la Chine et une population chacune en provenance du Laos et d'Imphal dans le nord-est de l'Inde. Le groupe II comprenait les onze autres populations provenant d'ailleurs en Inde (Assam, Orissa, Madhya Pradesh, Andra Pradesh et Kerala) de même que du Népal et de Sri Lanka. Ces analyses AFLP ont procuré des informations sur les origines de ces biotypes de la cécidomyie. En 1992, le biotype prédominant en Imphal est passé du biotype indien 3 à un nouveau biotype, 3M. Les présentes données montrent que le biotype 3M appartient au groupe I et n'a pas surgi par une mutation récente du biotype 3, lequel appartient au groupe II. Au contraire, les biotypes indiens 2 et 4 ont vraisemblablement divergé suite à des mutations récentes suivies de sélection, tout comme les biotypes chinois 1 et 4. L'émergence quasi simultanée de nouveaux biotypes au Kerala et au Sri Lanka durant la période 1985-1988 relevait vraisemblablement d'une coïncidence car ces biotypes ne sont pas très apparentés. Les empreintes AFLP ont également permis de détecter un dimorphisme sexuel chez les cécidomyies adultes et de distinguer la cécidomyie asiatique du riz de son principal parasite, le Platygaster oryzae.Mots clés : biotypes, Cecidomyiidae, insecte, Oryza sativa, Platygaster oryzae, population, dimorphisme sexuel.[Traduit par la Rédaction]